Misiunea OIM în Moldova a fost deschisă în 2001, însă Moldova a devenit oficial stat membru al OIM doar în 2003. Misiunea are ca scop asigurarea unei migrații umane și ordonate.

Fiind cea mai importantă organizație internațională în domeniul migrației, conform acordurilor reciproce între OIM și Guvernul Republicii Moldova, Misiunea OIM Moldova acționează, împreună cu partenerii săi din comunitatea internațională, în principal, în următoarele patru domenii:

  • Migrație și dezvoltare
  • Prevenire și protecție (combaterea traficului de persoane)
  • Managementul migrației
  • Migrația facilitată

Primele trei domenii enumerate mai sus alcătuiesc și departamentele din organizarea structurală a misiunii OIM Moldova, în timp ce „Migrația facilitată” face parte din departamentul operațional. În cadrul misiunii există, de asemenea, un departament care se ocupă de finanțe și administrare. Mai mult, OIM Moldova este responsabilă pentru asigurarea Misiunii Uniunii Europene de Asistență la Frontieră în Moldova și Ucraina (EUBAM) cu suport administrativ și logistic. EUBAM este finanțată integral de Comisia Europeană.